Kunstmatige selectie omvat het paren van twee individuen binnen een soort die de eigenschappen hebben die gewenst zijn voor de nakomelingen. In tegenstelling tot natuurlijke selectie, is kunstmatige selectie niet willekeurig en wordt gecontroleerd door de verlangens van mensen. Dieren, zowel gedomesticeerde als wilde dieren die nu in gevangenschap zijn, worden vaak onderworpen aan kunstmatige selectie door mensen om het ideale dier in uiterlijk, uiterlijk of andere gewenste kenmerken te krijgen.
Kunstmatige selectie is geen nieuwe praktijk. Charles Darwin, de vader van de evolutie, gebruikte kunstmatige selectie om zijn werk te ondersteunen toen hij op het idee kwam van natuurlijke selectie en de Theory of Evolution. Nadat hij met de HMS Beagle naar Zuid-Amerika en, misschien met name, de Galapagos-eilanden had gereisd, waar hij vinken met verschillend gevormde snavels waarnam, wilde Darwin zien of hij dit soort verandering in gevangenschap kon reproduceren.
Bij zijn terugkeer naar Engeland kweekte Darwin vogels. Door kunstmatige selectie over meerdere generaties, was Darwin in staat om nakomelingen te creëren met gewenste eigenschappen door parende ouders die die eigenschappen bezaten. Kunstmatige selectie bij vogels kan kleur, bekvorm en lengte, grootte en meer zijn.
Kunstmatige selectie bij dieren kan een winstgevende onderneming zijn. Veel eigenaren en trainers betalen bijvoorbeeld topdollar voor renpaarden met bepaalde stambomen. Kampioenrenpaarden worden na hun pensionering vaak gebruikt om de volgende generatie winnaars te fokken. Spierstelsel, grootte en zelfs botstructuur kunnen worden doorgegeven van ouder op nageslacht. Als er twee ouders kunnen worden gevonden met de gewenste renpaardkenmerken, is de kans nog groter dat de nakomelingen ook de eigenschappen van het kampioenschap hebben die eigenaren en trainers wensen.
Een veel voorkomend voorbeeld van kunstmatige selectie bij dieren is het fokken van honden. Net als bij renpaarden zijn bepaalde eigenschappen wenselijk in verschillende hondenrassen die deelnemen aan hondenshows. De juryleden kijken naar vachtkleuren en patronen, gedrag en zelfs tanden. Hoewel gedrag kan worden getraind, zijn er ook aanwijzingen dat sommige gedragskenmerken genetisch worden doorgegeven.
Zelfs bij honden die niet aan shows deelnemen, zijn bepaalde rassen populairder geworden. Er is veel vraag naar nieuwere hybriden zoals de Labradoodle, een mix tussen een Labrador retriever en een poedel, en de puggle, die afkomstig is van het fokken van een pug en een beagle. De meeste mensen die van deze hybriden houden, genieten van het unieke karakter en het uiterlijk van de nieuwe rassen. Fokkers kiezen de ouders op basis van eigenschappen die volgens hen gunstig zullen zijn bij de nakomelingen.
Kunstmatige selectie bij dieren kan ook worden gebruikt voor onderzoek. Veel laboratoria gebruiken knaagdieren zoals muizen en ratten om tests uit te voeren die niet klaar zijn voor menselijke proeven. Soms omvat het onderzoek het fokken van muizen om de eigenschap of het gen te krijgen dat bij de nakomelingen moet worden onderzocht. Omgekeerd onderzoeken sommige laboratoria het gebrek aan bepaalde genen. In dat geval worden muizen zonder die genen gefokt om nakomelingen te produceren die dat gen missen, zodat ze kunnen worden bestudeerd.
Elk gedomesticeerd dier of dier in gevangenschap kan kunstmatige selectie ondergaan. Van katten tot panda's tot tropische vissen, kunstmatige selectie bij dieren kan de voortzetting zijn van een bedreigde diersoort, een nieuw soort gezelschapsdier of een prachtig nieuw dier om naar te kijken. Hoewel deze eigenschappen misschien nooit door natuurlijke selectie tot stand komen, zijn ze haalbaar via fokprogramma's. Zolang mensen voorkeuren hebben, zal er een kunstmatige selectie bij dieren zijn om ervoor te zorgen dat aan die voorkeuren wordt voldaan.