De geschiedenis van schoenen - dat wil zeggen archeologisch en paleoantropologisch bewijs voor het vroegste gebruik van beschermende bedekkingen voor de menselijke voet - lijkt te beginnen tijdens de Midden-Paleolithische periode van ongeveer 40.000 jaar geleden.
De oudste schoenen die tot nu toe zijn teruggevonden, zijn sandalen op verschillende archaïsche (~ 6500-9000 jaar bp) en enkele Paleoindische (~ 9000-12.000 jaar bp) locaties in het zuidwesten van Amerika. Tientallen sandalen uit de archaïsche periode werden teruggevonden door Luther Cressman op de site Fort Rock in Oregon, direct gedateerd ~ 7500 BP. Fort Rock-achtige sandalen zijn ook gevonden op locaties van 10.500-9200 cal BP in Cougar Mountain en Catlow Caves.
Anderen omvatten het Chevelon Canyon-sandaal, daterend uit 8.300 jaar geleden, en enkele touwfragmenten op de Daisy Cave-site in Californië (8.600 jaar bp).
In Europa was conservering niet zo toevallig. Binnen de bovenste paleolithische lagen van de grotsite van Grotte de Fontanet in Frankrijk, toont een voetafdruk blijkbaar aan dat de voet een mocassinachtige bekleding had. Skeletresten van de Paleolithische vindplaatsen in Sunghir in Rusland (ca. 27.500 jaar bp) lijken voetbescherming te hebben gehad. Dat is gebaseerd op het herstel van ivoren kralen gevonden bij de enkel en voet van een begrafenis.
Een complete schoen werd ontdekt in de Areni-1-grot in Armenië en werd gemeld in 2010. Het was een schoen van het type mocassin, zonder vamp of zool, en het is gedateerd tot ~ 5500 jaar BP.
Eerder bewijs voor schoengebruik is gebaseerd op anatomische veranderingen die mogelijk zijn veroorzaakt door het dragen van schoenen. Erik Trinkaus heeft betoogd dat het dragen van schoenen fysieke veranderingen in de tenen veroorzaakt, en deze verandering wordt weerspiegeld in menselijke voeten vanaf het Midden-Paleolithicum. In feite betoogt Trinkaus dat smalle, graciele midden proximale vingerkootjes (tenen) in vergelijking met vrij robuuste onderste ledematen impliceert "gelokaliseerde mechanische isolatie van grondreactiekrachten tijdens de hiel en de teen".
Hij stelt voor dat schoeisel af en toe werd gebruikt door archaïsche neanderthalers en vroegmoderne mensen in het Midden-Paleolithicum en consequent door vroegmoderne mensen door het Midden-Paleolithicum.
Het vroegste bewijs van deze teenmorfologie dat tot nu toe is opgemerkt, is ongeveer 40.000 jaar geleden op de grotsite van Tianyuan 1 in Fangshan County, China.
Historici hebben opgemerkt dat schoenen in sommige, misschien vele culturen een speciale betekenis lijken te hebben. In Engeland uit de 17e en 18e eeuw werden bijvoorbeeld oude, versleten schoenen verborgen in de spanten en schoorstenen van huizen. Onderzoekers zoals Houlbrook suggereren dat hoewel de precieze aard van de praktijk onbekend is, een verborgen schoen sommige eigenschappen kan delen met andere verborgen voorbeelden van rituele recycling zoals secundaire begrafenissen, of een symbool kan zijn voor de bescherming van het huis tegen boze geesten. De tijdsdiepte van een bepaalde betekenis van schoenen lijkt te dateren uit ten minste de Chalcolithische periode: Tell Brak's oog-tempel in Syrië omvatte een kalkstenen votiefschoen. Het artikel van Houlbrook is een goed uitgangspunt voor mensen die dit merkwaardige probleem onderzoeken.