Het systeem met drie domeinen, ontwikkeld door Carl Woese in 1990, is een systeem voor het classificeren van biologische organismen.
Voordat Woese in 1977 archaea als bacterie ontdekte, geloofden wetenschappers dat er maar twee soorten leven waren: eukarya en bacteriën.
De hoogste rangorde die eerder werd gebruikt, was 'koninkrijk', gebaseerd op het Five Kingdom-systeem dat eind jaren zestig werd aangenomen. Dit classificatiesysteemmodel is gebaseerd op principes ontwikkeld door de Zweedse wetenschapper Carolus Linnaeus, wiens hiërarchische systeem organismen groepeert op basis van gemeenschappelijke fysieke kenmerken.
Naarmate wetenschappers meer leren over organismen, veranderen classificatiesystemen. Genetische sequencing heeft onderzoekers een geheel nieuwe manier gegeven om relaties tussen organismen te analyseren.
Het huidige Three Domain System groepeert organismen voornamelijk op basis van verschillen in ribosomaal RNA (rRNA) structuur. Ribosomaal RNA is een moleculaire bouwsteen voor ribosomen.
Onder dit systeem worden organismen ingedeeld in drie domeinen en zes koninkrijken. De domeinen zijn
De koninkrijken zijn
Dit Archaea-domein bevat eencellige organismen. Archaea heeft genen die vergelijkbaar zijn met zowel bacteriën als eukaryoten. Omdat ze qua uiterlijk erg op bacteriën lijken, werden ze oorspronkelijk aangezien voor bacteriën.
Net als bacteriën zijn archaea prokaryotische organismen en hebben ze geen membraangebonden kern. Ze missen ook interne celorganellen en velen zijn ongeveer even groot als en vergelijkbaar in vorm met bacteriën. Archaea reproduceren door binaire splijting, hebben één cirkelvormig chromosoom en gebruiken flagella om zich in hun omgeving te verplaatsen, net als bacteriën.
Archaea verschilt van bacteriën in celwandsamenstelling en verschilt van zowel bacteriën als eukaryoten in membraansamenstelling en rRNA-type. Deze verschillen zijn groot genoeg om te rechtvaardigen dat archaea een afzonderlijk domein hebben.
Archaea zijn extreme organismen die leven onder enkele van de meest extreme omgevingscondities. Dit omvat hydrothermische ventilatieopeningen, zure bronnen en onder Arctisch ijs. Archaea zijn onderverdeeld in drie hoofd phyla: Crenarchaeota, Euryarchaeota, en Korarchaeota.
Bacteriën worden geclassificeerd onder het Bacteriedomein. Deze organismen worden over het algemeen gevreesd omdat sommige pathogeen zijn en ziekten kunnen veroorzaken.