Er is momenteel enige discussie over hoeveel soorten cacao (theobroma spp) bestaan in de wereld of ooit hebben bestaan. Erkende (en besproken) variëteiten zijn onder meer Theobroma cacao ssp. cacao (Criollo genoemd en te vinden in heel Midden-Amerika); T. cacao spp. sphaerocarpum (Forastero genoemd en gevonden in het noordelijke Amazonegebied); en een hybride van de twee genaamd Trinitario. Recente genetische studies suggereren dat alle vormen van cacao gewoon versies van Forastero zijn. Als het waar is, is cacao afkomstig uit het hogere Amazonegebied van Colombia en Ecuador en is het door menselijke tussenkomst naar Midden-Amerika gebracht. Etnografische studies in het noordelijke Amazonegebied hebben aangetoond dat het gebruik van cacao beperkt was tot de productie van cacao chicha (bier) uit het fruit, niet uit het verwerken van de bonen.
Het vroegst bekende bewijs voor het gebruik van cacaobonen bevond zich buiten het Amazonebekken en dateert tussen ongeveer 1900-1500 voor Christus. Onderzoekers onderzochten met behulp van massaspectrometrie residuen aan de binnenkant van verschillende schalen uit de vroegste samenlevingen in Meso-Amerika en ontdekten bewijs van Theobromine in een tecomate in Paso de la Amada, een Mokaya-locatie in het zuiden van Chiapas, Mexico. Ze vonden ook een bowl-test positief voor Theobromine van de El Manati Olmec-site in Veracruz, daterend uit ongeveer 1650-1500 v.Chr..
Andere archeologische vindplaatsen met vroeg bewijs van chocoladegebruik zijn Puerto Escondido, Honduras, ongeveer 1150 v.Chr. En Colha, Belize, tussen 1000-400 v.Chr..
Het lijkt duidelijk dat de innovatie om cacaobomen te planten en te verzorgen een Meso-Amerikaanse uitvinding is. Tot voor kort geloofden geleerden dat, sinds het Maya-woord kakaw is afkomstig uit de Olmeken-taal, de Olmeken moeten de voorlopers zijn geweest van deze heerlijke vloeistof. Recente archeologische studies in Puerto Escondido in Honduras suggereren echter dat de oorspronkelijke stappen naar de domesticatie van cacao plaatsvonden vóór de opkomst van de Olmeken-beschaving toen Honduras actief handelde met de Soconusco-regio.
Archeologische vindplaatsen met bewijs voor vroege chocolade domesticatie zijn onder andere Paso de la Amada (Mexico), El Manati (Mexico), Puerto Escondido (Honduras), Bat'sub Cave (Belize), Xunantunich (Guatemala), Rio Azul (Guatemala), Colha ( Belize).
bronnen