DNA of deoxyribonucleïnezuur is het molecuul dat genetische informatie codeert in de meeste levende organismen. Sommige bacteriën gebruiken RNA voor hun genetische code, maar elk ander levend organisme zal als een DNA-bron voor dit project werken.
DNA-extractiematerialen
Hoewel je elke DNA-bron kunt gebruiken, werken sommige vooral goed. Erwten, zoals gedroogde groene erwten, zijn een uitstekende keuze. Spinaziebladeren, aardbeien, kippenlever en bananen zijn andere opties. Gebruik geen DNA van levende mensen of huisdieren, als een kwestie van ethiek.
100 ml (1/2 kop) van een DNA-bron
1 ml (⅛ theelepel) tafelzout, NaCl
200 ml koud water
enzymen om eiwitten te denatureren (bijv. vleesvermalser, vers ananassap of reinigingsoplossing voor contactlenzen)
30 ml (2 eetlepels) vloeibaar afwasmiddel
70-90% ontsmettingsalcohol of andere isopropyl- of ethylalcohol
blender
vergiet
beker of kom
test buizen
rietjes of houten spiesjes
Voer de DNA-extractie uit
Meng 100 ml DNA-bron, 1 ml zout en 200 ml koud water. Dit duurt ongeveer 15 seconden bij een hoge instelling. Je streeft naar een homogeen soepachtig mengsel. De blender verbreekt de cellen en maakt het DNA vrij dat binnenin is opgeslagen.
Giet de vloeistof door een zeef in een andere container. Je doel is om de grote vaste deeltjes te verwijderen. Houd de vloeistof; gooi de vaste stoffen weg.
Voeg 30 ml vloeibaar wasmiddel toe aan de vloeistof. Roer of wervel de vloeistof om het te mengen. Laat deze oplossing 5-10 minuten reageren voordat u doorgaat naar de volgende stap.
Voeg een snufje vleesvermalser of een scheutje ananassap of contactlensreinigingsoplossing toe aan elke flacon of tube. Wervel de inhoud voorzichtig om het enzym op te nemen. Hard roeren zal het DNA breken en het moeilijker maken om het in de container te zien.
Kantel elke buis en giet alcohol langs de zijkant van elk glas of plastic om een zwevende laag op de vloeistof te vormen. Alcohol is minder dicht dan water, dus het zal op de vloeistof drijven, maar je wilt het niet in de buizen gieten omdat het dan zal mengen. Als u de interface tussen de alcohol en elk monster onderzoekt, zou u een witte vezelige massa moeten zien. Dit is het DNA!
Gebruik een houten spies of een rietje om het DNA uit elke buis te vangen en te verzamelen. Je kunt het DNA onderzoeken met een microscoop of vergrootglas of in een kleine container met alcohol bewaren om het te bewaren.
Hoe het werkt
De eerste stap is om een bron te kiezen die veel DNA bevat. Hoewel je overal DNA kunt gebruiken, zullen bronnen met veel DNA uiteindelijk meer product opleveren. Het menselijke genoom is diploïd, wat betekent dat het twee kopieën van elk DNA-molecuul bevat. Veel planten bevatten meerdere kopieën van hun genetisch materiaal. Aardbeien zijn bijvoorbeeld octoploïde en bevatten 8 kopieën van elk chromosoom.
Het mengen van het monster breekt de cellen uit elkaar zodat u het DNA van andere moleculen kunt scheiden. Zout en detergens verwijderen eiwitten die normaal aan DNA zijn gebonden. Het wasmiddel scheidt ook de lipiden (vetten) van het monster. De enzymen worden gebruikt om het DNA te knippen. Waarom zou je het willen snijden? Het DNA is gevouwen en rond eiwitten gewikkeld, dus het moet worden vrijgemaakt voordat het kan worden geïsoleerd.
Nadat u deze stappen hebt voltooid, wordt het DNA gescheiden van andere celbestanddelen, maar u moet het nog steeds uit de oplossing halen. Dit is waar de alcohol in het spel komt. De andere moleculen in het monster lossen op in alcohol, maar DNA niet. Wanneer u alcohol (hoe kouder, hoe beter) op de oplossing giet, slaat het DNA-molecuul neer zodat u het kunt verzamelen.