Aminozuren

Aminozuren zijn een type organisch zuur dat zowel een carboxylgroep (COOH) als een aminogroep (NH) bevat₂). De algemene formule voor een aminozuur wordt hieronder gegeven. Hoewel de neutraal geladen structuur gewoonlijk wordt geschreven, is deze onnauwkeurig omdat de zure COOH en basische NH₂ groepen reageren met elkaar en vormen een intern zout dat een zwitterion wordt genoemd. Het zwitterion heeft geen netto kosten; er is één negatief (COO^-) en één positief (NH₃⁺) in rekening brengen.

Er zijn 20 aminozuren afgeleid van eiwitten. Hoewel er verschillende methoden zijn om ze te categoriseren, is een van de meest voorkomende om ze te groeperen op basis van de aard van hun zijketens.

Niet-polaire zijkettingen

Er zijn acht aminozuren met niet-polaire zijketens. Glycine, alanine en proline hebben kleine, niet-polaire zijketens en zijn allemaal zwak hydrofoob. Fenylalanine, valine, leucine, isoleucine en methionine hebben grotere zijketens en zijn sterker hydrofoob.

Polar, ongeladen zijkettingen

Er zijn ook acht aminozuren met polaire, ongeladen zijketens. Serine en threonine hebben hydroxylgroepen. Asparagine en glutamine hebben amidegroepen. Histidine en tryptofaan hebben heterocyclische aromatische amine-zijketens. Cysteïne heeft een sulfhydrylgroep. Tyrosine heeft een fenolische zijketen. De sulfhydrylgroep van cysteïne, fenolische hydroxylgroep van tyrosine en imidazolgroep van histidine vertonen alle een zekere mate van pH-afhankelijke ionisatie.

Opgeladen zijkettingen

Er zijn vier aminozuren met geladen zijketens. Asparaginezuur en glutaminezuur hebben carboxylgroepen aan hun zijketens. Elk zuur is volledig geïoniseerd bij pH 7,4. Arginine en lysine hebben zijketens met aminogroepen. Hun zijketens zijn volledig geprotoneerd bij pH 7,4.