Volgens antropologen die kaasvormen hebben gevonden die teruggaan tot die periode, kan het maken van kaas worden teruggevoerd tot 2.000 v.Chr. Cheesecake wordt echter verondersteld te zijn ontstaan in het oude Griekenland. In feite kan een vorm van cheesecake aan de atleten zijn geserveerd tijdens de eerste Olympische Spelen in 776 v.Chr. om ze energie te geven. Griekse bruiden uit die tijd kookten en serveerden ook cheesecake aan hun bruiloftsgasten.
In "The Oxford Companion to Food" merkt redacteur Alan Davidson op dat cheesecake rond 200 v.Chr. In Marcus Porcius "Cato's De re Rustica" werd genoemd en dat Cato beschreef hoe hij zijn kaas maakte libum (cake) met resultaten die erg lijken op moderne cheesecake. De Romeinen verspreidden de traditie van cheesecake uit Griekenland over heel Europa. Eeuwen later verscheen cheesecake in Amerika, met een verscheidenheid aan regionale recepten overgebracht door immigranten.
Wanneer Amerikanen nu aan cheesecake denken, wordt het meestal geassocieerd met een product op basis van roomkaas. Roomkaas werd uitgevonden in 1872 door de Amerikaanse zuivelproducent William Lawrence uit Chester, New York, die per ongeluk een methode tegenkwam om roomkaas te produceren terwijl hij probeerde een Franse kaas te reproduceren genaamd Neufchâtel.
In 1880 begon Lawrence zijn roomkaas in folieverpakkingen te distribueren onder auspiciën van de Empire Cheese Company uit South Edmeston, New York, waar hij het product produceerde. Je kent het echter misschien beter door de bekendere naam die Lawrence bedacht voor zijn "not Neufchâtel" -Philadelphia Brand Cream Cheese.
In 1903 kocht de Phoenix Cheese Company het bedrijf van Lawrence - en daarmee het handelsmerk van Philadelphia. In 1928 werd het merk gekocht door de Kraft Cheese Company. James L. Kraft vond in 1912 gepasteuriseerde kaas uit, wat leidde tot de ontwikkeling van gepasteuriseerde Philadelphia Brand roomkaas, momenteel de meest populaire kaas die wordt gebruikt voor het maken van kwarktaart. Kraft Foods bezit en produceert nog steeds Philadelphia Roomkaas.
Hoewel het cheesecake wordt genoemd omdat cheesecake over het algemeen ongezuurd is en meestal een korst heeft - of die korst nu wordt gebakken of niet - het is echt een vorm van taart. De meeste gebakken cheesecakes gebruiken een vlabasis voor het vullen bestaande uit melk, eieren, suiker, zout en vanille of andere smaakstoffen. Het standaard kwarktaartrecept bevat de toevoeging van roomkaas, maar zorgt voor variaties in het soort korst, andere smaakstoffen, zoals chocolade, en een verscheidenheid aan toppings die variëren van fruit tot noten tot snoep.
Een andere misvatting over cheesecake is dat het zoet moet zijn. De Franse klassieker, quiche, is in alle opzichten een hartige cheesecake. U kunt een willekeurig aantal recepten voor hartige kaastaarten vinden uit landen in Europa en de hele Verenigde Staten.