Ondanks geruchten over zijn homoseksuele neigingen had Achilles een kind - een zoon, geboren uit een korte affaire tijdens de Trojaanse oorlog..
De Griekse krijger Achilles wordt nooit in de Griekse geschiedenis afgebeeld als een getrouwde man. Hij had een nauwe relatie met Patroclus van Phthia die eindigde toen Patroclus vocht in zijn plaats in de Trojaanse oorlog en stierf. De dood van Patroclus is wat Achilles uiteindelijk ten strijde trok. Dat alles leidde tot speculaties dat Achilles homo was.
Nadat Achilles echter de Trojaanse oorlog was begonnen, werd Briseis, de dochter van de Trojaanse priester van Apollo genaamd Chryses, aan Achilles gegeven als oorlogsprijs. Toen koning van de Grieken Agamemnon Briseis zichzelf toe-eigende, uitte Achilles zijn verontwaardiging. Dat lijkt zeker te suggereren dat Achilles op zijn minst een parttime interesse in vrouwen had, ongeacht zijn relatie met Patroclus.
Een reden voor de verwarring kan ontstaan door Achilles 'moeder Thetis. Thetis was een nimf en een Nereïde die veel verschillende strategieën probeerde om haar geliefde zoon te beschermen, die hem het meest beroemd in de rivier de Styx dompelde om hem onsterfelijk te maken, of op zijn minst ongevoelig voor gevechtsverwondingen. Om hem uit de Trojaanse oorlog te houden, verborg ze Achilles, gekleed als een vrouw, aan het hof van koning Lycomedes op het eiland Skyros. Deidamia van de koning ontdekte zijn ware geslacht en had een affaire met hem. Een jongen werd geboren uit die affaire genaamd Neoptolemus.
De voorzorgen van Thetis waren allemaal voor niets: Odysseus, na zijn eigen gekke tochtontwijkende escapade, ontdekte de travestiet Achilles door middel van een list. Odysseus bracht snuisterijen naar het hof van koning Lycomedes en alle jonge vrouwen namen passende kerstballen behalve Achilles die zich aangetrokken voelde tot het ene mannelijke voorwerp, een zwaard. Achilles wilde nog steeds niet vechten - in plaats daarvan stuurde hij Patroclus de strijd in, en toen hij stierf in een strijd waarin Zeus stand-by stond en hem liet sterven, trok Achilles uiteindelijk het pantser aan en werd hij zelf gedood.
Neoptolemus, soms Pyrrhus ("vlamkleurig") genoemd vanwege zijn rode haar, werd in het laatste jaar van de Trojaanse oorlogen aan het vechten gebracht. De Trojaanse zienerin Helenus werd gevangen genomen door de Grieken en ze werd gedwongen om hen te vertellen dat ze alleen Troje zouden vangen als hun krijgers een afstammeling van Aeacus in de strijd hadden. Achilles was al dood, neergeschoten door een vergiftigde pijl in de hiel, de enige plek in zijn lichaam die niet ondoordringbaar werd door zijn duik in de Styx. Zijn zoon Neoptolemus werd de strijd in gestuurd en, zoals Helenus voorspelde, konden de Grieken Troje vangen. De aeneid meldt dat Neoptolemus Priamus en vele anderen heeft gedood als vergelding voor de dood van Achilles.
Neoptolemus overleefde de Trojaanse oorlog en leefde drie keer om te trouwen. Een van zijn vrouwen was Andromache, de weduwe van Hector, die was gedood door Achilles.
In het toneelstuk van de Griekse toneelschrijver Sophocles Philoctetes, Neoptolemus wordt afgeschilderd als een bedrieglijke man die het vriendelijke, gastvrije hoofdpersonage verraadt. Philoctetes was een Griek die werd verbannen op het eiland Lemnos toen de rest van de Grieken doorging naar Troje. Hij was gewond en gestrand als gevolg van zijn beledigende nimf (of misschien Hera of Apollo - de legende varieert op verschillende plaatsen) en werd ziek en alleen achtergelaten in een grot ver van zijn huis.
In het stuk waren Philoctetes 10 jaar verbannen toen Neoptolemus hem bezocht om hem terug te brengen naar Troje. Philoctetes smeekte hem om hem niet terug te brengen naar de strijd maar om hem mee naar huis te nemen. Neoptolemus beloofde dat te doen, maar in plaats daarvan neemt Philoctetes terug naar Troje, waar Philoctetes een van de mannen was die werd afgescheiden in het Trojaanse paard.