De zoon van James en Anne Ferguson, Patrick Ferguson werd geboren op 4 juni 1744 in Edinburgh, Schotland. De zoon van een advocaat, Ferguson ontmoette veel van de figuren van de Schotse Verlichting tijdens zijn jeugd, zoals David Hume, John Home en Adam Ferguson. In 1759, met de zevenjarige oorlog woedend, werd Ferguson aangemoedigd om een militaire carrière na te streven door zijn oom, brigadegeneraal James Murray. Een bekende officier, Murray diende later dat jaar onder majoor generaal James Wolfe in de Slag om Quebec. Op advies van zijn oom kocht Ferguson een commissie van cornets in de Royal North British Dragoons (Scots Grays).
In plaats van zich meteen bij zijn regiment aan te sluiten, heeft Ferguson twee jaar gestudeerd aan de Royal Military Academy in Woolwich. In 1761 reisde hij naar Duitsland voor actieve dienst bij het regiment. Kort na aankomst werd Ferguson ziek met een kwaal in zijn been. Hij was maandenlang bedlegerig en kon tot augustus 1763 niet meer meedoen met de Grijzen. Hoewel hij in staat was tot actieve dienst, werd hij de rest van zijn leven geplaagd door artritis in zijn been. Toen de oorlog was afgelopen, zag hij de garnizoen in Groot-Brittannië de komende jaren. In 1768 kocht Ferguson een captaincy in het 70e Regiment of Foot.
Varend naar West-Indië diende het regiment garnizoensplicht en hielp later bij het neerzetten van een slavenopstand op Tobago. Terwijl hij daar was, kocht hij een suikerplantage in Castara. Lijdend aan koorts en problemen met zijn been, keerde Ferguson terug naar Groot-Brittannië in 1772. Twee jaar later volgde hij een licht infanterie trainingskamp in Salisbury onder toezicht van generaal-majoor William Howe. Ferguson, een ervaren leider, maakte snel indruk op Howe met zijn vaardigheden in het veld. Tijdens deze periode werkte hij ook aan het ontwikkelen van een effectief stuitliggend musket.
Beginnend met eerder werk van Isaac de la Chaumette, creëerde Ferguson een verbeterd ontwerp dat hij op 1 juni demonstreerde. Het ontwerp was indrukwekkend op koning George III en werd op 2 december gepatenteerd en was in staat zes tot tien rondes per minuut af te vuren. Hoewel het op sommige manieren superieur is aan het standaard Brown Bess-musket van het Britse leger, is het Ferguson-ontwerp aanzienlijk duurder en kostte het veel meer tijd om te produceren. Ondanks deze beperkingen werden er ongeveer 100 geproduceerd en kreeg Ferguson het bevel over een Experimental Rifle Company in maart 1777 voor dienst in de Amerikaanse revolutie.
Aangekomen in 1777 voegde Fergusons speciaal uitgeruste eenheid zich bij het leger van Howe en nam deel aan de campagne om Philadelphia te veroveren. Op 11 september namen Ferguson en zijn mannen deel aan de Slag om Brandywine. In de loop van de gevechten koos Ferguson ervoor om om redenen van eer niet op een hooggeplaatste Amerikaanse officier te schieten. Uit rapporten bleek later dat het mogelijk graaf Casimir Pulaski of generaal George Washington was. Naarmate het gevecht vorderde, werd Ferguson geraakt door een musketbal die zijn rechterelleboog verbrijzelde. Met de val van Philadelphia werd hij naar de stad gebracht om te herstellen.
In de komende acht maanden onderging Ferguson een reeks operaties in de hoop zijn arm te redden. Deze bleken redelijk succesvol, hoewel hij nooit volledig gebruik van het ledemaat had herwonnen. Tijdens zijn herstel werd het geweerbedrijf van Ferguson ontbonden. In 1778 keerde hij terug naar actieve dienst en diende hij onder majoor-generaal Sir Henry Clinton in de Slag om Monmouth. In oktober stuurde Clinton Ferguson naar Little Egg Harbor River in het zuiden van New Jersey om een nest Amerikaanse kapers te elimineren. Aanvallend op 8 oktober verbrandde hij verschillende schepen en gebouwen voordat hij zich terugtrok.
Enkele dagen later hoorde Ferguson dat Pulaski in het gebied kampeerde en dat de Amerikaanse positie licht bewaakt werd. Aanvallen op 16 oktober, zijn troepen gedood ongeveer vijftig mannen voordat Pulaski arriveerde met hulp. Vanwege de Amerikaanse verliezen werd de verloving bekend als de Little Egg Harbor Massacre. Ferguson opereerde begin 1779 vanuit New York en voerde verkenningsmissies uit voor Clinton. In de nasleep van de Amerikaanse aanval op Stony Point droeg Clinton hem op toezicht te houden op de verdedigingswerken in het gebied. In december nam Ferguson het bevel over de Amerikaanse vrijwilligers, een troepenmacht van New York en New Jersey.
In het begin van 1780 voer het commando van Ferguson uit als onderdeel van het leger van Clinton dat probeerde Charleston, SC te veroveren. Toen hij in februari landde, werd Ferguson per ongeluk in de linkerarm gegooid toen luitenant-kolonel Banastre Tarleton het Britse legioen per ongeluk zijn kamp aanviel. Terwijl het beleg van Charleston vorderde, werkten de mannen van Ferguson om de Amerikaanse bevoorradingsroutes naar de stad af te snijden. Samen met Tarleton hielp Ferguson bij het verslaan van een Amerikaanse troepenmacht op 14 april in Monck's Corner. Vier dagen later verhoogde Clinton hem tot majoor en dateerde hij de promotie tot de vorige oktober.
Ferguson verhuisde begin mei naar de noordoever van de rivier de Cooper en nam deel aan de verovering van Fort Moultrie. Met de val van Charleston op 12 mei benoemde Clinton Ferguson als inspecteur van milities voor de regio en beschuldigde hem van het verhogen van eenheden van loyalisten. Terugkerend naar New York, verliet Clinton luitenant-generaal Lord Charles Cornwallis in bevel. In zijn rol als inspecteur slaagde hij erin om ongeveer 4.000 man groot te brengen. Na schermutselingen met lokale milities kreeg Ferguson de opdracht om 1.000 man naar het westen te brengen en de flank van Cornwallis te bewaken terwijl het leger Noord-Carolina binnenviel.
Ferguson vestigde zich op 7 september in Gilbert Town, NC en verhuisde drie dagen later naar het zuiden om een militiemacht onder leiding van kolonel Elijah Clarke te onderscheppen. Voordat hij vertrok, stuurde hij een bericht naar de Amerikaanse milities aan de andere kant van de Appalachian Mountains met het bevel hun aanvallen te staken of hij zou de bergen oversteken en "hun land verwoesten met vuur en zwaard." Woedend door de dreigingen van Ferguson mobiliseerden deze milities zich en begonnen op 26 september tegen de Britse commandant in te gaan. Toen hij hoorde van deze nieuwe dreiging, begon Ferguson zich terug te trekken naar het zuiden en vervolgens naar het oosten met het doel zich te herenigen met Cornwallis.
Begin oktober ontdekte Ferguson dat de bergmilities zijn mannen aan het winnen waren. Op 6 oktober besloot hij een standpunt in te nemen en nam een positie in op King Mountain. Zijn bevel versterkte de hoogste delen van de berg en werd de volgende dag laat aangevallen. Tijdens de Battle of Kings Mountain omsingelden de Amerikanen de berg en overweldigden uiteindelijk de mannen van Ferguson. In de loop van de gevechten werd Ferguson van zijn paard geschoten. Terwijl hij viel, greep zijn voet in het zadel en werd hij de Amerikaanse linies in getrokken. Stervend, de overwinnende militie uitgekleed en op zijn lichaam geplast voordat het begraven in een ondiep graf. In de jaren 1920 werd een marker opgericht over het graf van Ferguson dat nu in Kings Mountain National Military Park ligt.