Generaal Robert E. Lee werd op 2 april 1865 uit Petersburg gedwongen en trok zich terug naar het westen met zijn leger uit Noord-Virginia. Omdat zijn situatie wanhopig was, probeerde Lee te bevoorraden voordat hij naar het noorden naar North Carolina vertrok om zich bij generaal Joseph Johnston te voegen. Marcherend in de nacht van 2 april in de ochtend van 3 april, waren de Zuidelijken van plan om af te spreken in Amelia Court House waar voorraden en rantsoenen werden verwacht. Toen luitenant-generaal Ulysses S. Grant moest pauzeren om Petersburg en Richmond te bezetten, kon Lee wat ruimte tussen de legers maken.
Aangekomen in Amelia op 4 april, vond Lee treinen vol met munitie maar geen met voedsel. Gedwongen om te pauzeren, zond Lee foerageerpartijen uit, vroeg de lokale bevolking om hulp en bestelde voedsel dat vanuit Danville langs de spoorweg naar het oosten werd gestuurd. Na Petersburg en Richmond te hebben beveiligd, duwde Grant de troepen onder majoor-generaal Philip Sheridan naar voren om Lee na te jagen. In westelijke richting vochten Sheridan's Cavalry Corps en bijgevoegde infanterie verschillende achterhoede-acties met de Confederates en gingen ze verder in een poging de spoorweg voor Lee te doorbreken. Toen hij hoorde dat Lee zich concentreerde op Amelia, begon hij zijn mannen naar de stad te verplaatsen.
Lee verloor zijn voorsprong op Grant's mannen en geloofde dat zijn vertraging fataal was. Lee verliet Amelia op 5 april ondanks het feit dat hij weinig voedsel voor zijn mannen veiligstelde. Hij trok zich terug naar het westen langs de spoorweg richting Jetersville en ontdekte al snel dat de mannen van Sheridan daar het eerst waren aangekomen. Verbluft omdat deze ontwikkeling een directe mars naar Noord-Carolina onmogelijk maakte, koos Lee ervoor om vanwege het late uur niet aan te vallen en voerde in plaats daarvan een nachtmars naar het noorden rond de links van de Unie met het doel Farmville te bereiken waar hij dacht dat de voorraden wachtten. Deze beweging werd rond het ochtendgloren opgemerkt en de troepen van de Unie hervatten hun achtervolging (Kaart).
De volgende dag leed het leger van Lee een verpletterende ommekeer toen elementen zwaar werden verslagen in de Battle of Sayler's Creek. De nederlaag zag hem ongeveer een kwart van zijn leger verliezen, evenals verschillende generaals, waaronder luitenant-generaal Richard Ewell. Lee zag de overlevenden van het gevecht naar het westen stromen en riep: "Mijn God, is het leger opgelost?" Lee consolideerde zijn mannen in Farmville vroeg op 7 april en was in staat om zijn mannen gedeeltelijk te bevoorraden voordat hij vroeg in de middag werd buitengesloten. Lee hoopte in westelijke richting de bevoorradingstreinen te bereiken die op het Appomattox-station stonden te wachten.
Dit plan werd vernietigd toen de cavalerie van de Unie onder majoor-generaal George A. Custer in de stad aankwam en de treinen verbrandde. Terwijl het leger van Lee zich op 8 april concentreerde in het Appomattox Court House, namen de cavalerie van de Unie blokkerende posities in op een heuvelrug ten zuidwesten van de stad. Grant wilde de campagne beëindigen en liet drie infanteriekorpsen de hele nacht door marcheren om de cavalerie te ondersteunen. In de hoop de spoorweg in Lynchburg te bereiken, ontmoette Lee zijn commandanten op 8 april en besloot hij de volgende ochtend aan te vallen met het doel de weg te openen.
Bij het ochtendgloren op 9 april begon het tweede korps van majoor-generaal John B. Gordon de cavalerie van Sheridan aan te vallen. Terwijl ze de eerste lijn terugduwden, begon hun aanval te vertragen naarmate ze de tweede innamen. Gordons mannen bereikten de top van de bergkam en waren ontmoedigd om de Union XXIV en V Corps te zien inzetten voor de strijd. Omdat hij niet in staat was om tegen deze troepen in te gaan, informeerde Gordon Lee: 'Zeg generaal Lee dat ik tegen mijn korps heb gevochten tot een frazzle, en ik vrees dat ik niets kan doen tenzij ik zwaar wordt ondersteund door het korps van Longstreet.' Dit was niet mogelijk omdat het korps van luitenant-generaal James Longstreet door het Union II Corps werd aangevallen.
Met zijn leger aan drie kanten omringd, accepteerde Lee de onvermijdelijke verklaring: "Dan is er niets meer voor mij om te gaan dan naar General Grant te gaan en ik zou liever duizend doden sterven." Terwijl de meeste officieren van Lee de voorkeur gaven aan overgave, vreesden anderen niet dat dit zou leiden tot het einde van de oorlog. Lee probeerde ook te voorkomen dat zijn leger zou wegsmelten om verder te vechten als guerrillastrijders, een beweging die volgens hem op lange termijn schadelijk zou zijn voor het land. Om 8:00 uur reed Lee weg met drie van zijn assistenten om contact te maken met Grant.
Verschillende uren correspondentie volgden, wat leidde tot een staakt-het-vuren en een formeel verzoek van Lee om overleveringsvoorwaarden te bespreken. Het huis van Wilmer McLean, wiens huis in Manassas tijdens de Eerste Slag om Bull Run had gediend als verbonden hoofdkwartier, werd geselecteerd om de onderhandelingen te organiseren. Lee arriveerde eerst, droeg zijn mooiste uniform en wachtte op Grant. De commandant van de Unie, die ernstige hoofdpijn had gehad, kwam laat aan, gekleed in een versleten privé-uniform met alleen zijn schouderbanden die zijn rang aangeven..
Grant was overweldigd door de emotie van de ontmoeting en had er moeite mee om ter zake te komen. Hij gaf er de voorkeur aan zijn vorige ontmoeting met Lee tijdens de Mexicaans-Amerikaanse oorlog te bespreken. Lee stuurde het gesprek terug naar de overgave en Grant legde zijn voorwaarden uiteen. Grant's voorwaarden voor de overgave van het leger van Noord-Virginia waren als volgt:
"Ik stel voor om de overgave van het leger van N. Va. Op de volgende voorwaarden te ontvangen, namelijk: Rollen van alle officieren en mannen in tweevoud te maken. Een exemplaar dat aan een door mij aangewezen officier moet worden gegeven, het andere om te worden behouden door de officier of officieren die u aanwijst. De officieren om hun individuele voorwaardelijke vrijlating te geven om geen wapens tegen de regering van de Verenigde Staten op te nemen totdat ze op de juiste manier zijn uitgewisseld, en elke compagnie of regimentcommandant ondertekent een soortgelijke voorwaardelijke vrijlating voor de mannen van hun bevelen. De wapens, artillerie en openbare eigendommen moeten worden geparkeerd en gestapeld en overgedragen aan de officier die door mij is aangesteld om ze te ontvangen. Dit zal niet de zijarmen van de officieren omarmen, noch hun privépaarden of bagage. elke officier en man zal toegestaan worden om naar hun huizen terug te keren, om niet gestoord te worden door de Amerikaanse autoriteiten, zolang ze hun voorwaardelijke vrijlating en de geldende wetten naleven waar ze kunnen verblijven. "
Daarnaast bood Grant ook aan om de Zuidelijken hun paarden en muilezels mee naar huis te laten nemen voor gebruik in het voorjaar. Lee accepteerde de genereuze voorwaarden van Grant en de vergadering eindigde. Toen Grant wegreed van het McLean-huis, begonnen de troepen van de Unie te juichen. Toen Grant hen hoorde, beval hij onmiddellijk dat het zou stoppen, en verklaarde dat hij niet wilde dat zijn mannen hun onlangs verslagen vijand verhoogden.
De volgende dag gaf Lee zijn mannen een afscheidsrede en de besprekingen gingen verder over de formele overgaveceremonie. Hoewel de Zuidelijken een dergelijke gebeurtenis wilden vermijden, ging het verder onder leiding van generaal-majoor Joshua Lawrence Chamberlain. Onder leiding van Gordon marcheerden 27.805 Zuidelijken om zich twee dagen later over te geven. Tijdens hun processie beval Chamberlain de troepen van de Unie onder aandacht te brengen en "wapens te dragen" als een teken van respect voor de overwonnen vijand. Deze groet werd teruggegeven door Gordon.
Met de overgave van het leger van Noord-Virginia begonnen andere Zuidelijke legers zich over te geven rond het zuiden. Terwijl Johnston zich op 26 april overgaf aan majoor-generaal William T. Sherman, bleven andere Zuidelijke commando's operationeel tot capituleren in mei en juni.