Een skeletstructuur is een grafische weergave van de rangschikking van atomen en bindingen in een molecuul.
Skeletstructuren worden getoond in twee dimensies waar elementensymbolen worden gebruikt voor de atomen en ononderbroken lijnen om bindingen daartussen weer te geven. Meerdere bindingen worden weergegeven door meerdere ononderbroken lijnen. Dubbele bindingen worden getoond met twee lijnen en drievoudige bindingen worden getoond met drie lijnen.
Koolstofatomen worden geïmpliceerd wanneer twee bindingen elkaar ontmoeten en er geen atoom wordt vermeld. Waterstofatomen worden geïmpliceerd wanneer het aantal bindingen minder is dan vier op een koolstofatoom. Waterstofatomen worden weergegeven als ze niet zijn gebonden aan een koolstofatoom.
3D-arrangementen worden weergegeven door solide en gehashte wiggen. Solide wiggen impliceren banden die naar de kijker komen en gehashte wiggen zijn banden die van de kijker af wijzen.