Alle levende wezens moeten dezelfde set kenmerken vertonen om te kunnen worden geclassificeerd als levend (of eenmaal levend voor degenen die op enig moment zijn afgestorven). Deze kenmerken omvatten het handhaven van homeostase (een stabiele interne omgeving, zelfs wanneer de externe omgeving verandert), het vermogen om nakomelingen te produceren, een werkend metabolisme (wat betekent dat chemische processen in het organisme plaatsvinden), erfelijkheid vertonen (het doorgeven van eigenschappen van de ene generatie op de vervolgens), groei en ontwikkeling, reactievermogen op de omgeving waarin het individu zich bevindt, en deze moet bestaan uit een of meer cellen.
Virussen zijn een interessant onderwerp dat virologen en biologen bestuderen vanwege hun relatie met levende wezens. In feite worden virussen niet als levende dingen beschouwd omdat ze niet alle kenmerken van het leven vertonen waarnaar hierboven wordt verwezen. Daarom is er geen echte 'remedie' als je een virus oploopt. Alleen de symptomen kunnen worden behandeld totdat het immuunsysteem het hopelijk oplost. Het is echter geen geheim dat virussen ernstige schade aan levende dingen kunnen veroorzaken. Ze doen dit door in wezen parasieten te worden voor gezonde gastheercellen. Maar als virussen niet leven, kunnen ze evolueren? Als we de betekenis van "evolueren" als verandering in de tijd beschouwen, dan evolueren virussen inderdaad. Dus waar kwamen ze vandaan? Die vraag moet nog worden beantwoord.
Er zijn drie op evolutie gebaseerde hypothesen over hoe virussen tot stand zijn gekomen, waarover wetenschappers discussiëren. Anderen wijzen ze alle drie af en zoeken nog steeds naar antwoorden elders. De eerste hypothese wordt de 'ontsnappingshypothese' genoemd. Er werd beweerd dat virussen eigenlijk stukjes RNA of DNA zijn die uit verschillende cellen zijn gebroken of 'ontsnapt' en vervolgens andere cellen zijn binnengevallen. Deze hypothese wordt in het algemeen verworpen omdat het geen ingewikkelde virale structuren verklaart, zoals capsules die het virus omringen, of mechanismen die het virale DNA in gastheercellen kunnen injecteren. De 'reductiehypothese' is een ander populair idee over de oorsprong van virussen. Deze hypothese beweert dat virussen ooit cellen zelf waren die parasieten van grotere cellen werden. Hoewel dit veel verklaart waarom gastheercellen nodig zijn voor virussen om te gedijen en zich voort te planten, wordt het vaak bekritiseerd vanwege het gebrek aan bewijs, inclusief waarom kleine parasieten op geen enkele manier op virussen lijken. De laatste hypothese over de oorsprong van virussen is bekend geworden als de 'virus-eerste hypothese'. Dit zegt dat virussen eerder cellen hadden gedateerd - of in ieder geval tegelijk met de eerste cellen werden gemaakt. Omdat virussen echter gastheercellen nodig hebben om te overleven, houdt deze hypothese niet stand.
Omdat virussen zo klein zijn, zijn er geen virussen in het fossielenbestand. Omdat echter veel soorten virussen hun virale DNA integreren in het genetische materiaal van de gastheercel, zijn sporen van virussen te zien wanneer DNA van oude fossielen in kaart wordt gebracht. Virussen passen zich zeer snel aan en evolueren omdat ze in relatief korte tijd meerdere generaties nakomelingen kunnen produceren. Het kopiëren van het virale DNA is gevoelig voor veel mutaties in elke generatie, omdat de controlemechanismen van de gastheercellen niet zijn uitgerust om het "proeflezen" van het virale DNA te verwerken. Deze mutaties kunnen ervoor zorgen dat de virussen snel veranderen in een korte periode, waardoor de virale evolutie op zeer hoge snelheden wordt uitgevoerd.
Sommige paleovirologen geloven dat RNA-virussen, die alleen RNA als genetisch materiaal dragen en geen DNA, mogelijk de eerste virussen zijn die evolueerden. De eenvoud van het RNA-ontwerp, samen met het vermogen van dit soort virussen om extreem snel te muteren, maakt ze uitstekende kandidaten voor de eerste virussen. Anderen geloven echter dat de DNA-virussen als eerste zijn ontstaan. Het meeste hiervan is gebaseerd op de hypothese dat virussen ooit parasitaire cellen of genetisch materiaal waren dat hun gastheer ontsnapte om parasitair te worden.