De grot van Denisova is een schuilkelder met belangrijke middenpaleolithische en bovenste paleolithische beroepen. Gelegen in het noordwestelijke Altai-gebergte op ongeveer 6 km van het dorp Chernyi Anui, toont de site menselijke bewoning van het Midden-Paleolithicum tot het Late Midden-Paleolithicum, beginnend ~ 200.000 jaar geleden. Het belangrijkste is dat in de grot het eerste bewijs werd gevonden van Denisovans, een nieuw geïdentificeerde soort mens.
De grot, gevormd uit Silurisch zandsteen, bevindt zich ~ 28 meter boven de rechteroever van de Anui-rivier in de buurt van de bovenloop. Het bestaat uit verschillende korte galerijen die zich uitstrekken vanuit een centrale kamer, met een totale grotoppervlakte van ongeveer 270 m². De centrale kamer meet 9x11 meter, met een hoog gebogen plafond.
Opgravingen in de centrale kamer in Denisova hebben 13 pleistocene bezettingen onthuld tussen 30.000 en ~ 125.000 jaar bp. De chronologische data zijn in grote lijnen radiothermalluminescentiedata (RTL) die zijn genomen op sedimenten, met uitzondering van de Strata 9 en 11, die een handvol radiokoolstofdata op houtskool hebben. De RTL-data op de laagste datum worden onwaarschijnlijk geacht, waarschijnlijk alleen in het bereik van 125.000 jaar geleden.
Klimaatgegevens afgeleid van palynologie (pollen) en faunale taxa (dierlijk bot) suggereren dat de oudste beroepen zich in berken- en dennenbossen bevonden, met enkele grote boomloze gebieden op grotere hoogten. De volgende periodes fluctueerden aanzienlijk, maar de koudste temperaturen vonden plaats vlak voor het laatste glaciale maximum, ~ 30.000 jaar geleden, toen een steppe-omgeving werd opgericht.
Hominide overblijfselen die uit de grot zijn teruggevonden, zijn onder meer vier Denisovans, twee Neanderthalers en één individu, Denisova 11, vertegenwoordigd door een fragment van een lang bot, waarvan genetisch onderzoek aangeeft dat het het kind was van een Neanderthaler moeder en een Denisovan vader. Het individu was ten minste 13 jaar oud bij overlijden: en haar genetische samenstelling geeft aan dat ook haar vader het resultaat was van een seksueel congres tussen een Neanderthaler en een Denisovan.
De eerste Denisovan in de grot leefde tussen 122.7-194.4 duizend jaar geleden (kya); een ander leefde tussen 105.6 en 136.4 kya; en twee leefden tussen 51.6 en 76.2 kya. Neanderthalers leefden tussen 90,0 en 147,3 kya; en het Denisovan / Neanderthaler kind leefde tussen 79.3 en 118.1 kya. De meest recente datum wijkt niet zoveel af van de nabijgelegen Ishim-site in Ust, een eerste Paleolithische vindplaats tussen 45-48 kya, waardoor de mogelijkheid bestaat dat Ust 'Ishim mogelijk een Denisovan-bezetting is geweest.
Hoewel de site grotendeels stratigrafisch vrij intact is, scheidt helaas een grote discontinuïteit de twee UP-niveaus 9 en 11, en het contact tussen hen is aanzienlijk verstoord, waardoor het moeilijk is om de datums van de artefacten erin veilig te scheiden.
Denisova is het type site voor wat Russische archeologen de Denisova-variant van Altai Mousterian hebben genoemd, die behoort tot de eerste bovenste paleolithische periode. Steengereedschap in deze technologie vertoont het gebruik van de parallelle reductiestrategie voor kernen, grote aantallen laminaire plano's en gereedschappen gevormd op grote bladen. Radiale en parallelle kernen, beperkt aantal echte messen en een diverse reeks racloirs worden ook geïdentificeerd in de stenen gereedschapsassemblages.
Verschillende opmerkelijke kunstvoorwerpen zijn teruggevonden in de Altai Mousteriaanse lagen van de grot, waaronder decoratieve voorwerpen van bot, mammoetslagtand, dierentanden, gefossiliseerde struisvogel eischaal en weekdierschelp. Twee fragmenten van een stenen armband gemaakt van geboord bewerkt en gepolijst donkergroen chloritoliet werden ontdekt in deze UP-niveaus in Denisova.
Een set botgereedschappen, waaronder kleine naalden met geboorde ogen, priemen en hangers, en een verzameling cilindrische botkralen is ook gevonden in de bovenste paleolithische afzettingen. Denisova bevat het vroegste bewijs van de vervaardiging van ogennaalden in Siberië.
De grot van Denisova werd meer dan een eeuw geleden ontdekt, maar de afzettingen van het Pleistoceen werden pas in 1977 erkend. Sindsdien hebben uitgebreide opgravingen door de Russische Academie van Wetenschappen in Denisova en nabijgelegen locaties van Ust-Karakol, Kara-Bom, Anuy 2 en Okladnikov opgenomen aanzienlijk bewijsmateriaal over het Siberische Midden- en Bovenpaleolithicum.