In de jaren 1970 ontstond een nieuwe groep jagers in Afghanistan. Ze noemden zichzelf moedjahedien (soms gespeld als mujahidin), een woord dat aanvankelijk werd toegepast op Afghaanse jagers die zich verzetten tegen de duw van de Britse Raj in Afghanistan in de 19e eeuw. Maar wie waren deze 20e-eeuwse mujahideen?
Het woord "mujahideen" komt uit dezelfde Arabische wortel als heilige oorlog, wat "strijd" betekent. Een Mujahid is dus iemand die worstelt of iemand die vecht. In de context van Afghanistan in de late 20e eeuw, waren de Mujahideen islamitische strijders die hun land verdedigden tegen de Sovjet-Unie, die Afghanistan binnenvielen in 1979 en daar tien jaar lang een bloedige oorlog vochten.
De Mujahideen van Afghanistan waren buitengewoon divers, waaronder etnische Pashtuns, Oezbeken, Tadzjieken en anderen. Sommigen waren Shi'a-moslims, gesponsord door Iran, terwijl de meeste facties uit soennitische moslims bestonden. Naast de Afghaanse jagers, meldden moslims uit andere landen zich aan om lid te worden van de Mujahideen. Veel kleinere aantallen Arabieren (inclusief Osama bin Laden, 1957-2011), jagers uit Tsjetsjenië en anderen haastten zich om Afghanistan te helpen. De Sovjetunie was tenslotte officieel een atheïstische natie, niet navolging van de islam, en de Tsjetsjenen hadden hun eigen anti-Sovjetklachten.
De mujahideen ontstonden uit lokale milities, geleid door regionale krijgsheren, die onafhankelijk wapens over heel Afghanistan vochten om de Sovjet-invasie te bestrijden. De coördinatie tussen de verschillende mujahideen-facties werd ernstig beperkt door bergachtig terrein, taalverschillen en traditionele rivaliteit tussen verschillende etnische groepen.
Terwijl de Sovjetbezetting voortduurde, raakte het Afghaanse verzet steeds meer verenigd in zijn oppositie. Tegen 1985 vocht de meerderheid van de Mujahideen als onderdeel van een brede alliantie die bekend staat als de Islamitische Eenheid van Mujahideen in Afghanistan. Deze alliantie bestond uit troepen van de legers van zeven grote krijgsheren, dus het was ook bekend als de Seven Party Mujahideen Alliance of de Peshawar Seven.
De beroemdste (en waarschijnlijk meest effectieve) van de mujahideen-commandanten was Ahmed Shah Massoud (1953-2001), bekend als de "Leeuw van de Panjshir." Zijn troepen vochten onder de vlag van de Jamiat-i-Islami, een van de Peshawar Seven-facties onder leiding van Burhanuddin Rabbani, die later de 10e president van Afghanistan zou worden. Massoud was een strategisch en tactisch genie, en zijn mujahideen waren een cruciaal onderdeel van het Afghaanse verzet tegen de Sovjet-Unie in de jaren tachtig.
Om verschillende redenen steunden buitenlandse regeringen ook de Mujahideen in de oorlog tegen de Sovjets. De Verenigde Staten waren in detentie met de Sovjets verzeild, maar hun expansieve verhuizing naar Afghanistan maakte president Jimmy Carter boos, en de VS zouden geld en wapens leveren aan de Mujahideen via tussenpersonen in Pakistan voor de duur van het conflict. (De VS was nog steeds smarting van het verlies in de Vietnam-oorlog, dus het land stuurde geen gevechtstroepen.) De Volksrepubliek China steunde ook de Mujahideen, net als Saoedi-Arabië.
De Afghaanse Mujahideen verdienen het leeuwendeel van de eer voor hun overwinning op het Rode Leger. Gewapend met hun kennis van het bergachtige terrein, hun vasthoudendheid en hun pure onwil om een buitenlands leger Afghanistan te laten overstijgen, vochten kleine groepen van vaak slecht uitgeruste Mujahideen tegen een van de superkrachten ter wereld. In 1989 werden de Sovjets gedwongen zich in schande terug te trekken na 15.000 manschappen te hebben verloren.
Voor de Sovjets was het een zeer dure fout. Sommige historici noemen de kosten en onvrede over de Afghaanse oorlog als een belangrijke factor in de ineenstorting van de Sovjet-Unie enkele jaren later. Voor Afghanistan was het ook een bitterzoete overwinning; meer dan 1 miljoen Afghanen werden gedood en de oorlog bracht het land in een staat van politieke chaos waardoor de fundamentalistische Taliban uiteindelijk de macht in Kaboel overnamen.