Een burgerrechtenbeweging in 1964, genaamd Freedom Summer, was een campagne die werd gestart om zwarten in de zuidelijke Verenigde Staten te laten stemmen. Duizenden studenten en burgerrechtenactivisten, zowel blank als zwart, sloten zich aan bij de organisatie, Congress on Racial Equality (CORE) en reisden naar zuidelijke staten om kiezers te registreren. In deze atmosfeer werden drie burgerrechtenwerkers vermoord door leden van de Ku Klux Klan.
Michael Schwerner, een 24-jarige uit Brooklyn, New York, en de 21-jarige James Chaney uit Meridian, Mississippi, werkten in en rond Neshoba County, Mississippi, om zwarten te registreren om te stemmen, "Freedom Schools" te openen en zwart te organiseren boycots van blanke bedrijven in Meridan.
De activiteiten van de burgerrechtenwerkers maakten het gebied Klu Klux Klan woedend en waren van plan het gebied van de meer prominente activisten te bevrijden. Michael Schwerner, of "Goatee" en "Jew-Boy" zoals de Klan hem noemde, werd een belangrijk doelwit van de Ku Klux Klan, na zijn succes van het organiseren van de Meridan-boycot en zijn vastberadenheid om de lokale zwarten te registreren om te stemmen was meer succesvoller dan de pogingen van de Klan om angst in de zwarte gemeenschappen te brengen.
De Ku Klux Klan was zeer actief in Mississippi in de jaren 1960 en veel van de leden waren lokale zakenmensen, wetshandhavers en prominente mannen in de gemeenschappen. Sam Bowers was de keizerlijke tovenaar van de White Knights tijdens "Freedom Summer" en had een grote hekel aan Schwerner. In mei 1964 ontvingen de KKK-leden van Lauderdale en Neshoba bericht van Bowers dat Plan 4 was geactiveerd. Plan 4 was om van Schwerner af te komen.
De Klan hoorde dat Schwerner op de avond van 16 juni een bijeenkomst had gepland met leden in de Mount Zion Church in Longdale, Mississippi. De kerk zou een toekomstige locatie worden voor een van de vele Freedom Schools die in Mississippi openden. Leden van de kerk hielden die avond een zakelijke bijeenkomst en aangezien de 10 rond 22.00 uur de kerk verlieten. die nacht ontmoetten ze oog in oog met meer dan 30 klansmen opgesteld met jachtgeweren.
De Klan was echter slecht geïnformeerd, omdat Schwerner eigenlijk in Oxford, Ohio was. Gefrustreerd omdat ze de activist niet had gevonden, begon de Klan de kerkleden te verslaan en brandde de kerk met houtskelet op de grond. Schwerner hoorde van het vuur en hij, samen met James Chaney en Andrew Goodman, die allemaal een driedaags CORE-seminar bijwoonden in Oxford, besloten terug te keren naar Longdale om het incident op de Mount Zion Church te onderzoeken. Op 20 juni vertrokken de drie in een blauwe Ford-stationwagen van CORE naar het zuiden.
Schwerner was zich zeer bewust van het gevaar om een burgerrechtenwerker te zijn in Mississippi, vooral in Neshoba County, dat een reputatie had als bijzonder onveilig. Na een nacht te hebben gestopt in Meridian, MS, ging de groep rechtdoor naar Neshoba Country om de uitgebrande kerk te inspecteren en enkele van de geslagen leden te ontmoeten. Tijdens de bezoeken leerden ze dat het echte doelwit van de KKK Schwerner was, en ze werden gewaarschuwd dat sommige lokale blanke mannen hem probeerden te vinden.
Om 15:00. de drie in de goed zichtbare blauwe Core-wagen, vertrokken om terug te keren naar Meridan, mevrouw. Gestationeerd op het Core-kantoor in Meridian was Core-medewerker, Sue Brown, die door Schwerner werd verteld als de drie om 4:30 niet terug waren pm, toen waren zij in moeilijkheden. Beslisend dat Highway 16 een veiligere route was, draaiden de drie erop, westwaarts, door Philadelphia, mevrouw, terug naar Meridan. Een paar mijl buiten Philadelphia zag Klan-lid, plaatsvervangend sheriff Cecil Price, de CORE-wagen op de snelweg.
Price zag niet alleen de auto, maar hij herkende ook de bestuurder, James Chaney. De Klan haatte Chaney, die een zwarte activist en een geboren Mississippiaan was. Price trok de wagen over en arresteerde en zette de drie studenten gevangen wegens verdenking van brandstichting in het vuur van de Mount Zion Church.
Nadat de drie niet op tijd naar Meridan waren teruggekeerd, plaatsten CORE-werknemers de gevangenis in de provincie Neshoba met de vraag of de politie enige informatie had over de drie burgerrechtenwerkers. Gevangene Minnie Herring ontkende elke kennis van hun verblijfplaats. Alle gebeurtenissen die plaatsvonden nadat de drie gevangen waren genomen, is onzeker, maar één ding is zeker bekend, ze werden nooit meer levend gezien. De datum was 21 juni 1964.
Tegen 23 juni waren FBI-agent John Proctor en een team van 10 agenten in Neshoba Country om de verdwijning van de drie mannen te onderzoeken. Waar de KKK niet op had gerekend, was de nationale aandacht die de verdwijning van de drie burgerrechtenwerkers zou ontbranden. Vervolgens drukte president Lyndon B. Johnson op J. Edgar Hoover om de zaak op te lossen. Het eerste FBI-kantoor in Mississippi werd geopend en de militairen brachten zeilers naar Neshoba County om te helpen bij het zoeken naar de vermiste mannen.
De zaak werd bekend als MIBURN, voor Mississippi Burning, en top FBI-inspecteurs werden gestuurd om te helpen met het onderzoek.
De FBI die de verdwijning van de drie burgerrechtenwerkers in Mississippi in juni 1964 onderzocht, kon eindelijk de gebeurtenissen samenvoegen die plaatsvonden vanwege informanten van Ku Klux Klan die er waren op de avond van de moorden.
Tegen december 1964 had Klan-lid James Jordan, een informant van de FBI, hen voldoende informatie verstrekt om hun arrestaties van 19 mannen in de provincies Neshoba en Lauderdale te beginnen, wegens samenzwering om Schwerner, Chaney en Goodman hun burgerrechten te ontnemen..
Binnen een week na de arrestatie van de 19 mannen verwierp de Amerikaanse commissaris de aanklachten dat de bekentenis van Jordanië die tot de arrestaties leidde, was afgezworen.
Een federale grand jury in Jackson, MS, handhaafde de aanklachten tegen de 19 mannen, maar op 24 februari 1965 zei federale rechter William Harold Cox, bekend als een die-hard segregationist, dat alleen Rainey en Price handelden "onder de kleur van staatswet 'en hij gooide de andere 17 aanklachten weg.
Pas in maart 1966 zou het Amerikaanse Hooggerechtshof Cox teniet doen en 18 van de 19 oorspronkelijke aanklachten herstellen.
Het proces begon op 7 oktober 1967 in Meridian, Mississippi, met rechter Cox als voorzitter. De hele proef doordrong een houding van raciale vooroordelen en KKK-verwantschap. De jury was helemaal blank met één lid en een toegelaten ex-Klansman. Rechter Cox, die gehoord was dat hij Afro-Amerikanen als chimpansees verwees, was van weinig nut voor de officieren van justitie.
Drie Klan-informanten, Wallace Miller, Delmar Dennis en James Jordan, gaven belastende getuigenissen over de details die hebben geleid tot de moord en Jordan getuigde over de daadwerkelijke moord.
De verdediging bestond uit karakterloosheid, familieleden en buren die getuigen ter ondersteuning van de beschuldigde alibi's.
In de slotargumenten van de regering vertelde John Doar de juryleden dat wat hij en de andere advocaten tijdens het proces zeiden snel zou worden vergeten, maar "wat jullie hier vandaag doen 12 zal lang worden onthouden."
Op 20 oktober 1967 werd het vonnis uitgesproken. Van de 18 beklaagden werden er zeven schuldig bevonden en acht niet schuldig. Degenen die schuldig bevonden, waren onder meer plaatsvervangend sheriff Cecil Price, Imperial Wizard Sam Bowers, Wayne Roberts, Jimmy Snowden, Billey Posey en Horace Barnett. Rainey en eigenaar van het pand waar de lichamen werden blootgelegd, Olen Burrage behoorden tot de vrijgesprokenen. De jury kon geen uitspraak doen in de zaak van Edgar Ray Killen.
Cox legde een straf op op 29 december 1967.