De Slag om Lepanto was een belangrijke marine-verloving tijdens de Ottomaanse-Habsburgoorlogen. De Heilige Liga versloeg de Ottomanen in Lepanto op 7 oktober 1571.
Na de dood van Suleiman de Prachtige en de beklimming van Sultan Selim II naar de Ottomaanse troon in 1566, begonnen de plannen voor de uiteindelijke verovering van Cyprus. Sinds 1489 in handen van de Venetianen, was het eiland grotendeels omringd door Ottomaanse bezittingen op het vasteland en bood het een veilige haven voor zeerovers die de Ottomaanse scheepvaart regelmatig aanvielen. Met het einde van een langdurig conflict met Hongarije in 1568, ging Selim verder met zijn ontwerpen op het eiland. De Ottomanen landden een invasietroepen in 1570, veroverden Nicosia na een bloedige belegering van zeven weken en wonnen verschillende overwinningen voordat ze aankwamen bij het laatste Venetiaanse bolwerk van Famagusta. Niet in staat om door de verdediging van de stad te dringen, belegerden ze in september 1570. In een poging de ondersteuning van de Venetiaanse strijd tegen de Ottomanen te versterken, werkte paus Pius V onvermoeibaar door een alliantie van de christelijke staten in de Middellandse Zee op te bouwen.
In 1571 verzamelden de christelijke mogendheden in de Middellandse Zee een grote vloot om de groeiende dreiging van het Ottomaanse rijk het hoofd te bieden. De christelijke troepen kwamen bijeen in Messina, Sicilië in juli en augustus, en werden geleid door Don John van Oostenrijk en bevatten schepen uit Venetië, Spanje, de pauselijke staten, Genua, Savoye en Malta. Varend onder de vlag van de Heilige Liga, bestond de vloot van Don John uit 206 galeien en 6 gallassen (grote galeien die artillerie bereden). Roeiend naar het oosten, pauzeerde de vloot bij Viscardo in Kefalonia waar het hoorde van de val van Famagusta en de marteling en moord op de Venetiaanse commandanten daar. Blijvend slecht weer Don John ging door naar Sami en arriveerde op 6 oktober. Terugkomend op zee de volgende dag ging de vloot van de Heilige Liga de Golf van Patras binnen en ontmoette al snel de Ottomaanse vloot van Ali Pasha.
Ali Pasha had het commando over 230 galeien en 56 galliots (kleine galeien) en verliet zijn basis in Lepanto en trok naar het westen om de vloot van de Heilige Liga te onderscheppen. Toen de vloten elkaar zagen, vormden ze zich voor de strijd. Voor de Holy League, Don John, aan boord van de kombuis echt, verdeelde zijn strijdkrachten in vier divisies, met de Venetianen onder Agostino Barbarigo aan de linkerkant, zichzelf in het midden, de Genuese onder Giovanni Andrea Doria aan de rechterkant, en een reserve geleid door Álvaro de Bazán, markies de Santa Cruz aan de achterkant. Bovendien duwde hij de brillen voor zijn linker- en middendivisie naar buiten, waar ze de Ottomaanse vloot konden bombarderen.
Vliegen met zijn vlag van sultanarozijn, Ali Pasha leidde het Ottomaanse centrum, met Chulouk Bey aan de rechterkant en Uluj Ali aan de linkerkant. Toen de strijd begon, zonken de brillen van de Heilige Liga twee galeien en verstoorden de Ottomaanse formaties met hun vuur. Toen de vloten naderden, zag Doria dat de lijn van Uluj Ali verder reikte dan de zijne. Doria ging naar het zuiden om niet geflankeerd te worden en opende een kloof tussen zijn divisie en Don John's. Uluj Ali zag het gat, draaide zich naar het noorden en viel de opening aan. Doria reageerde hierop en al snel waren zijn schepen aan het duelleren met Uluj Ali.
In het noorden slaagde Chulouk Bey erin de linkerflank van de Heilige Liga te keren, maar bepaalde weerstand van de Venetianen en de tijdige komst van een gallass, sloeg de aanval af. Kort nadat de strijd begon, vonden de twee vlaggenschepen elkaar en begon er een wanhopige strijd tussen echt en sultanarozijn. Spaanse troepen werden twee aaneengesloten afgeslagen toen ze probeerden aan boord te gaan van de Ottomaanse kombuis en versterkingen van andere schepen waren nodig om het tij te keren. Bij de derde poging, met hulp van de kombuis van Álvaro de Bazán, konden de mannen van Don John het nemen sultanarozijn daarbij Ali Pasha vermoorden.
Tegen de wens van Don John werd Ali Pasha onthoofd en zijn hoofd op een snoek getoond. De aanblik van het hoofd van hun commandant had een zware impact op het Ottomaanse moraal en ze begonnen zich rond 16.00 uur terug te trekken. Uluj Ali, die succes had tegen Doria en het Maltese vlaggenschip veroverde Capitana, trok zich terug met zestien galeien en vierentwintig galliots.
Bij de Slag om Lepanto verloor de Heilige Liga 50 galeien en leed ongeveer 13.000 slachtoffers. Dit werd gecompenseerd door het bevrijden van een vergelijkbaar aantal christelijke slaven van de Ottomaanse schepen. Naast de dood van Ali Pasha verloren de Ottomanen 25.000 doden en gewonden en werden 3.500 extra gevangen genomen. Hun vloot verloor 210 schepen, waarvan 130 werden veroverd door de Heilige Liga. Komend op wat werd gezien als een crisispunt voor het christendom, leidde de overwinning in Lepanto tot Ottomaanse expansie in de Middellandse Zee en verhinderde dat hun invloed zich naar het westen verspreidde. Hoewel de vloot van de Heilige Liga niet in staat was om hun overwinning te benutten vanwege het begin van de winterweer, bevestigden operaties in de komende twee jaar effectief een verdeling van de Middellandse Zee tussen de christelijke staten in het westen en de Ottomanen in het oosten.