De "nieuwe wetten" van 1542 waren een reeks wetten en voorschriften die door de koning van Spanje in november 1542 werden goedgekeurd om de Spanjaarden te reguleren die de inboorlingen in Amerika, met name in Peru, tot slaaf maakten. De wetten waren buitengewoon impopulair in de Nieuwe Wereld en leidden direct tot een burgeroorlog in Peru. De furore was zo groot dat koning Charles uiteindelijk, uit angst dat hij zijn nieuwe koloniën volledig zou verliezen, gedwongen werd veel van de meer impopulaire aspecten van de nieuwe wetgeving op te schorten.
Amerika was in 1492 ontdekt door Christopher Columbus: een pauselijke stier in 1493 verdeelde de nieuw ontdekte landen tussen Spanje en Portugal. Kolonisten, ontdekkingsreizigers en conquistadores van alle soorten begonnen onmiddellijk op weg naar de koloniën, waar ze de inboorlingen martelden en doodden met duizenden om hun land en rijkdom te veroveren. In 1519 veroverde Hernan Cortes het Azteekse rijk in Mexico: ongeveer vijftien jaar later versloeg Francisco Pizarro het Inca-rijk in Peru. Deze inheemse rijken hadden veel goud en zilver en de mannen die deelnamen werden zeer rijk. Dit op zijn beurt inspireerde meer en meer avonturiers om naar Amerika te komen in de hoop op de volgende expeditie die een inheems koninkrijk zou veroveren en plunderen.
Met de grote inheemse rijken in Mexico en Peru in puin, moesten de Spanjaarden een nieuw regeringssysteem invoeren. De succesvolle veroveraars en koloniale ambtenaren gebruikten de encomienda systeem. Onder het systeem kreeg een individu of gezin land, waar in het algemeen al inwoners woonden. Een soort "deal" was impliciet: de nieuwe eigenaar was verantwoordelijk voor de inboorlingen: hij zou zorgen voor hun instructie in het christendom, hun opleiding en hun veiligheid. In ruil daarvoor zouden de inboorlingen voedsel, goud, mineralen, hout of wat dan ook voor waardevolle goederen uit het land halen. De encomienda landen zouden van de ene generatie op de volgende overgaan, waardoor de families van de veroveraars zich konden vestigen als lokale adel. In werkelijkheid was het encomienda-systeem weinig meer dan slavernij onder een andere naam: de inboorlingen werden gedwongen om in velden en mijnen te werken, vaak totdat ze letterlijk dood vielen.
Sommigen verzetten zich tegen de gruwelijke mishandelingen van de inheemse bevolking. Al in 1511 in Santo Domingo vroeg een broeder, Antonio de Montesinos, aan de Spanjaarden met welk recht zij een volk waren binnengevallen, tot slaaf gemaakt, verkracht en beroofd dat hen geen kwaad had gedaan. Bartolomé de Las Casas, een Dominicaanse priester, begon dezelfde vragen te stellen. Las Casas, een invloedrijk man, had het oor van de koning en hij vertelde over de onnodige dood van miljoenen Indiërs, die tenslotte Spaanse onderdanen waren. Las Casas was behoorlijk overtuigend en koning Karel van Spanje besloot uiteindelijk iets te doen aan de moorden en martelingen die in zijn naam werden uitgevoerd.
De 'nieuwe wetten', zoals de wetgeving bekend werd, voorzagen in ingrijpende veranderingen in de Spaanse koloniën. De inboorlingen moesten als vrij worden beschouwd en de eigenaren van de encomiendas konden niet langer van hen gratis arbeid of diensten eisen. Ze moesten wel een bepaald bedrag betalen, maar extra werk moest worden betaald. Inlanders moesten eerlijk worden behandeld en uitgebreide rechten krijgen. Encomiendas toegekend aan leden van de koloniale bureaucratie of de geestelijkheid moesten onmiddellijk aan de kroon worden teruggegeven. De clausules van de Nieuwe Wetten die het meest verontrustend waren voor de Spaanse kolonisten, waren degenen die het verlies van encomiendas of inheemse arbeiders verklaarden door degenen die hadden deelgenomen aan burgeroorlogen (die bijna alle Spanjaarden in Peru waren) en een bepaling die encomiendas niet erfelijk maakte. : alle encomiendas zouden terugkeren naar de kroon bij het overlijden van de huidige houder.
De reactie op de nieuwe wetten was snel en ingrijpend: overal op Spaans Amerika waren conquistadores en kolonisten woedend. Blasco Nuñez Vela, de Spaanse onderkoning, arriveerde begin 1544 in de Nieuwe Wereld en kondigde aan dat hij van plan was de nieuwe wetten te handhaven. In Peru, waar de voormalige veroveraars het meest te verliezen hadden, verzamelden de kolonisten zich achter Gonzalo Pizarro, de laatste van de gebroeders Pizarro (Juan en Francisco stierven en Hernando Pizarro leefde nog maar in de gevangenis in Spanje). Pizarro hief een leger op en verklaarde dat hij de rechten zou verdedigen waar hij en zoveel anderen zo hard voor hadden gevochten. Bij de slag om Añaquito in januari 1546 versloeg Pizarro onderkoning Núñez Vela, die stierf in de strijd. Later versloeg een leger onder Pedro de la Gasca Pizarro in april 1548: Pizarro werd geëxecuteerd.
De revolutie van Pizarro werd neergeslagen, maar de opstand had de koning van Spanje laten zien dat de Spanjaarden in de Nieuwe Wereld (en Peru in het bijzonder) serieus waren over het beschermen van hun belangen. Hoewel de koning van mening was dat de nieuwe wetten moreel juist waren, vreesde hij dat Peru zichzelf een onafhankelijk koninkrijk zou verklaren (veel volgelingen van Pizarro hadden hem aangespoord om dat ook te doen). Charles luisterde naar zijn adviseurs, die hem vertelden dat hij de nieuwe wetten beter serieus kon nemen of dat hij het risico liep delen van zijn nieuwe rijk te verliezen. De nieuwe wetten werden opgeschort en een verwaterde versie werd aangenomen in 1552.
De Spanjaarden hadden een gemengd record in Amerika als koloniale macht. De meest afschuwelijke misstanden deden zich voor in de koloniën: inboorlingen werden tot slaaf gemaakt, vermoord, gemarteld en verkracht in de verovering en het vroege deel van de koloniale periode en later werden ze ontkracht en uitgesloten van macht. Individuele wreedheden zijn te talrijk en vreselijk om hier op te sommen. Conquistadores zoals Pedro de Alvarado en Ambrosius Ehinger bereikten wreedheden die bijna ondenkbaar zijn voor moderne sentimenten.
Hoe verschrikkelijk de Spanjaarden ook waren, er waren een paar verlichte zielen, zoals Bartolomé de Las Casas en Antonio de Montesinos. Deze mannen vochten ijverig voor inheemse rechten in Spanje. Las Casas produceerde boeken over Spaanse misstanden en was niet verlegen om krachtige mannen in de koloniën aan de kaak te stellen. Koning Charles I van Spanje, zoals Ferdinand en Isabela vóór hem en Philip II na hem, hadden zijn hart op de juiste plaats: al deze Spaanse heersers eisten dat de inboorlingen eerlijk werden behandeld. In de praktijk was de goodwill van de koning echter moeilijk te handhaven. Er was ook een inherent conflict: de koning wilde dat zijn inheemse onderdanen gelukkig waren, maar de Spaanse kroon werd steeds afhankelijker van de gestage stroom van goud en zilver uit de koloniën, waarvan een groot deel werd geproduceerd door slavenarbeid in de mijnen.
Wat de nieuwe wetten betreft, deze vormden een belangrijke verschuiving in het Spaanse beleid. Het tijdperk van verovering was voorbij: bureaucraten, geen veroveraars, zouden de macht hebben in Amerika. Het wegnemen van de veroveraars van hun encomiendas betekende dat de ontluikende adellijke klasse in de kiem smeekte. Hoewel Koning Charles de Nieuwe Wetten opschortte, had hij andere middelen om de machtige Nieuwe Wereldelite te verzwakken en binnen een generatie of twee waren de meeste encomiendas toch teruggekeerd naar de kroon.