Karakorum (of de Karakorum en soms gespeld Kharakhorum of Qara Qorum) was de hoofdstad voor de grote Mongoolse leider Genghis Khan en, volgens minstens één geleerde, het belangrijkste stoppunt op de zijderoute in de 12e en 13e eeuw CE . Onder de vele architectonische hoogstandjes, zei William van Rubruck die in 1254 bezocht, was een enorme zilveren en gouden boom gemaakt door een ontvoerde Parijzenaar. De boom had pijpen die wijn, merriesmelk, rijstweide en honingweide uitgieten, op bevel van de Khan.
Er is vandaag weinig te zien in het Karakorum dat dateert uit de Mongoolse bezetting - een stenen schildpad die in een lokale steengroeve is gesneden als een sokkelbasis is alles dat boven de grond blijft. Maar er zijn archeologische overblijfselen op het terrein van het latere klooster Erdene Zuu, en een groot deel van de geschiedenis van Karakorum leeft voort in historische documenten. Informatie is te vinden in de geschriften van 'Ala-al-Din' Ata-Malik Juvayni, een Mongoolse historicus die daar in de vroege jaren 1250 woonde. In 1254 werd het bezocht door Wilhelm von Rubruk (ook bekend als William van Rubruck) [ca 1220-1293], een Franciscaanse monnik die kwam als gezant van koning Lodewijk IX van Frankrijk; en de Perzische staatsman en historicus Rashid al-Din [1247-1318] woonde in het Karakorum in zijn rol als onderdeel van het Mongoolse hof.
Archeologisch bewijs toont aan dat de eerste nederzetting van de uiterwaarden van de rivier de Orkhon (of Orchon) in Mongolië een stad was met trellis-tenten, gers of yurts genoemd, die in de 8e-9e eeuw CE werden opgericht door de Oeigoerse afstammelingen van de Steppe Society uit de Bronstijd. De tentenstad was gelegen op een grasvlakte aan de voet van de bergen van Changai (Khantai of Khangai) aan de rivier de Orkhon, ongeveer 350 kilometer ten westen van Ulaan Bataar. En in 1220 vestigde de Mongoolse keizer Genghis Khan (vandaag gespeld als Chinggis Khan) hier een permanente hoofdstad.
Hoewel het niet de meest agrarische vruchtbare locatie was, was Karakorum strategisch gelegen op de kruising van oost-west- en noord-zuid-zijdewegroutes in Mongolië. De Karakorum werd uitgebreid onder Genghis 'zoon en opvolger Ögödei Khan [regeerde 1229-1241], en zijn opvolgers ook; in 1254 had de stad ongeveer 10.000 inwoners.
Volgens het rapport van de reizende monnik William van Rubruck omvatten de permanente gebouwen in het Karakorum het paleis van Khan en verschillende grote nevenpaleizen, twaalf boeddhistische tempels, twee moskeeën en een oosterse christelijke kerk. De stad had een buitenmuur met vier poorten en een slotgracht; het hoofdpaleis had zijn eigen muur. Archeologen hebben ontdekt dat de stadsmuur 1,5 tot 2,5 km lang is en zich uitstrekt ten noorden van het huidige Erdene Zuu-klooster.
Grote straten strekten zich vanuit elk van de hoofdpoorten uit naar het stadscentrum. Buiten de permanente kern bevond zich een groot gebied waar Mongolen hun latwerktenten opzetten (ook wel gers of yurts genoemd), een gewoon patroon zelfs vandaag de dag. De stadsbevolking werd geschat op ongeveer 10.000 mensen in 1254, maar ongetwijfeld fluctueerde het seizoensgebonden. De bewoners waren nomaden van de Steppe Society, en zelfs de Khan verhuisde regelmatig woningen.
Water werd de stad binnengebracht door een reeks kanalen die van de Orkhon-rivier leidden; gebieden tussen de stad en de rivier werden gecultiveerd en onderhouden door extra irrigatiekanalen en reservoirs. Dat watercontrolesysteem werd in de jaren 1230 in Karakorum opgericht door Ögödei Khan, en de boerderijen verbouwden gerst, bezem en vossenstaartgierst, groenten en kruiden: maar het klimaat was niet bevorderlijk voor de landbouw en het meeste voedsel om de bevolking te ondersteunen moest geïmporteerd worden. De Perzische historicus Rashid al-Din meldde dat in de late 13e eeuw de bevolking van Karakorum werd bevoorraad door vijfhonderd wagens voedselvracht per dag.
Meer kanalen werden geopend in de late 13e eeuw, maar de landbouw was altijd onvoldoende voor de behoeften van de nomadische bevolking die voortdurend verschoof. Op verschillende tijdstippen zouden boeren dienst kunnen doen in oorlogen, en op andere tijden zouden de Khans boeren van andere locaties dienstplichtig zijn..
De Karakorum was een centrum voor metaalbewerking, met smeltovens buiten het stadscentrum. In de centrale kern waren een reeks workshops, met ambachtslieden die handelsmaterialen van lokale en exotische bronnen maakten.
Archeologen hebben werkplaatsen geïdentificeerd die gespecialiseerd zijn in brons-, goud-, koper- en ijzerbewerking. Lokale industrieën produceerden glasparels en gebruikten edelstenen en edelstenen om sieraden te maken. Botgravure en verwerking van berkenschors werden vastgesteld; en garenproductie wordt aangetoond door de aanwezigheid van spilkransen, hoewel fragmenten van geïmporteerde Chinese zijde ook zijn gevonden.
Archeologen hebben veel bewijs gevonden voor de lokale productie en import van aardewerk. De oventechnologie was Chinees; vier ovens in Mantou-stijl zijn tot nu toe binnen de stadsmuren opgegraven, en er zijn er minstens 14 buiten bekend. De ovens van Karakorum produceerden serviesgoed, architecturale sculpturen en beeldjes. Elite-soorten aardewerk voor de Khan werden geïmporteerd uit de Chinese keramische productielocatie van Jingdezhen, inclusief de beroemde blauwe en witte waren van Jingdezhen, tegen de eerste helft van de 14e eeuw.
De Karakorum bleef de hoofdstad van het Mongoolse rijk tot 1264 toen Kublai Khan keizer van China werd en zijn verblijf verhuisde naar Khanbaliq (ook wel Dadu of Daidu genoemd, in wat tegenwoordig het moderne Beijing is). Sommige archeologische gegevens suggereren dat dit gebeurde tijdens een aanzienlijke droogte. De verhuizing was wreed, volgens recent onderzoek: de volwassen mannen gingen naar Daidu, maar de vrouwen, kinderen en ouderen bleven achter om de kuddes te verzorgen en voor zichzelf te zorgen.
De Karakorum werd grotendeels verlaten in 1267 en volledig verwoest door Ming-dynastietroepen in 1380 en nooit herbouwd. In 1586 werd op deze locatie het boeddhistische klooster Erdene Zuu (soms Erdeni Dzu) gesticht.