De belegering van Jeruzalem werd uitgevoerd van 7 juni tot 15 juli 1099, tijdens de Eerste Kruistocht (1096-1099).
Nadat ze Antiochië hadden veroverd in juni 1098, bleven de kruisvaarders in het gebied en debatteerden over hun koers. Terwijl sommigen tevreden waren om zich op de reeds veroverde landen te vestigen, begonnen anderen hun eigen kleine campagnes te voeren of op te roepen tot een mars naar Jeruzalem. Op 13 januari 1099, nadat het beleg van Maarat was beëindigd, vertrok Raymond van Toulouse naar het zuiden richting Jeruzalem, bijgestaan door Tancred en Robert van Normandië. Deze groep werd de volgende maand gevolgd door troepen onder leiding van Godfried van Bouillon. De kruisvaarders vorderden langs de Middellandse Zeekust en ondervonden weinig weerstand van lokale leiders.
Onlangs veroverd door de Fatimiden, hadden deze leiders beperkte liefde voor hun nieuwe overheersers en waren ze bereid vrije doorgang door hun land te verlenen en openlijk handel te drijven met de Kruisvaarders. Aangekomen in Arqa, belegerde Raymond de stad. Samen met de troepen van Godfrey in maart zette het gecombineerde leger het beleg voort, hoewel de spanningen onder de commandanten hoog opliepen. Toen de belegering op 13 mei werd afgebroken, trokken de kruisvaarders naar het zuiden. Omdat de Fatimiden nog steeds probeerden hun greep op de regio te consolideren, benaderden ze de leiders van de Kruisvaarders met aanbiedingen van vrede in ruil voor het stoppen van hun opmars.
Deze werden afgewezen en het christelijke leger trok door Beiroet en Tyrus voordat het land in Jaffa landde. Toen ze op 3 juni Ramallah bereikten, vonden ze het dorp verlaten. Zich bewust van de bedoelingen van de kruisvaarder, begon de Fatimidische gouverneur van Jeruzalem, Iftikhar ad-Daula, zich voor te bereiden op een belegering. Hoewel de stadsmuren nog steeds beschadigd waren door de Fatimide verovering van de stad een jaar eerder, verdreef hij de christenen van Jeruzalem en vergiftigde hij verschillende van de waterputten in het gebied. Terwijl Tancred werd uitgezonden om Bethlehem te vangen (genomen op 6 juni), arriveerde het kruisvaardersleger op 7 juni voor Jeruzalem.
Bij gebrek aan voldoende mannen om de hele stad te investeren, zetten de kruisvaarders tegenover de noordelijke en westelijke muren van Jeruzalem in. Terwijl Godfrey, Robert van Normandië en Robert van Vlaanderen de muren van het noorden bedekten tot aan de toren van David, nam Raymond de verantwoordelijkheid voor het aanvallen van de toren naar de berg Sion. Hoewel voedsel geen direct probleem was, hadden de kruisvaarders problemen met het verkrijgen van water. Dit, in combinatie met berichten dat een hulpmacht Egypte verliet, dwong hen om snel te bewegen. Bij een frontale aanval op 13 juni werden de kruisvaarders teruggedraaid door het Fatimid-garnizoen.
Vier dagen later werd de hoop van de kruisvaarders gestimuleerd toen Genuese schepen met voorraden op Jaffa aankwamen. De schepen werden snel ontmanteld en het hout snelde naar Jeruzalem voor het bouwen van belegeringsapparatuur. Dit werk begon onder het oog van de Genuese commandant, Guglielmo Embriaco. Naarmate de voorbereidingen vorderden, maakten de kruisvaarders op 8 juli een berouwvolle processie rond de stadsmuren die uitmondde in preken over de Olijfberg. In de daaropvolgende dagen werden twee belegeringstorens voltooid. Ad-Daula, zich bewust van de activiteiten van de kruisvaarder, werkte aan het versterken van de verdedigingswerken tegenover waar de torens werden gebouwd.
Het aanvalsplan van de kruisvaarder riep Godfrey en Raymond op om aan te vallen aan tegenovergestelde uiteinden van de stad. Hoewel dit werkte om de verdedigers te splitsen, was het plan waarschijnlijk het resultaat van vijandigheid tussen de twee mannen. Op 13 juli begonnen de troepen van Godfrey met hun aanval op de noordelijke muren. Daarbij namen ze de verdedigers verrast door de belegeringstoren tijdens de nacht verder naar het oosten te verplaatsen. Op 14 juli braken ze door de buitenmuur, ze drongen aan en vielen de volgende dag de binnenmuur aan. Op de ochtend van 15 juli begonnen de mannen van Raymond hun aanval vanuit het zuidwesten.
Geconfronteerd met voorbereide verdedigers, worstelde Raymond's aanval en zijn belegeringstoren was beschadigd. Terwijl de strijd op zijn front woedde, waren de mannen van Godfrey erin geslaagd de binnenmuur te bereiken. Zich uitspreidend, konden zijn troepen een nabijgelegen poort naar de stad openen waardoor de kruisvaarders Jeruzalem binnen konden zwermen. Toen het nieuws van dit succes de troepen van Raymond bereikte, verdubbelden ze hun inspanningen en waren ze in staat de Fatimidische verdediging te doorbreken. Met de kruisvaarders die de stad op twee punten binnenkwamen, begonnen de mannen van ad-Daula terug te vluchten naar de Citadel. Toen hij verder verzet zag als hopeloos, gaf ad-Daula zich over toen Raymond bescherming bood. Kruisvaarders riepen "Deus volt" of "Deus lo volt" ("God wil het") in de viering.
In de nasleep van de overwinning begonnen de kruisvaarders een massale slachting van het verslagen garnizoen en de moslim- en joodse bevolking van de stad. Dit werd hoofdzakelijk bestraft als een methode om de stad te 'reinigen' en tegelijkertijd een bedreiging voor de achterste kruisvaarders weg te nemen, omdat ze binnenkort naar de Egyptische hulptroepen zouden moeten marcheren. Na het doel van de kruistocht te hebben genomen, begonnen de leiders de buit te verdelen. Godfried van Bouillon werd op 22 juli verdediger van het Heilig Graf genoemd, terwijl Arnulf van Chocques op 1 augustus de patriarch van Jeruzalem werd. Vier dagen later ontdekte Arnulf een relikwie van het Ware Kruis.
Deze benoemingen zorgden voor enige strijd binnen het kruisvaarderskamp toen Raymond en Robert van Normandië boos waren op de verkiezing van Godfrey. Met het bericht dat de vijand naderde, marcheerde het kruisvaardersleger op 10 augustus. Ze ontmoetten de Fatimiden in de Slag om Ascalon en wonnen op 12 augustus een beslissende overwinning..